Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NESP48681 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NESP48681 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NESP48681 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NESP48681 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NESP48681 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms