Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIA4P48058 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms