Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms