Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CASQ1P31415 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CASQ1P31415 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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