Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLIP1P30622 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLIP1P30622 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms