Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTF2E1P29083 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms