Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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