Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NFKBIAP25963 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms