Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms