Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MMP11P24347 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MMP11P24347 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MMP11P24347 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MMP11P24347 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MMP11P24347 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MMP11P24347 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP11P24347 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP11P24347 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP11P24347 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP11P24347 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP11P24347 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP11P24347 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MMP11P24347 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms