Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PAX7P23759 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX7P23759 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX7P23759 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX7P23759 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX7P23759 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX7P23759 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX7P23759 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX7P23759 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PAX7P23759 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX7P23759 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX7P23759 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX7P23759 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX7P23759 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX7P23759 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX7P23759 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX7P23759 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PAX7P23759 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms