Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FGFR4P22455 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FGFR4P22455 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms