Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD247P20963 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD247P20963 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD247P20963 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD247P20963 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD247P20963 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD247P20963 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD247P20963 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms