Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAPN3P20807 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms