Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LMNB1P20700 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms