Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC9A1P19634 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC9A1P19634 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms