Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms