Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms