Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ODC1P11926 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms