Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00032P0C843 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00032P0C843 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms