Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPBP07199 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPBP07199 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPBP07199 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms