Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB2P05107 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms