Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPXO76031 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPXO76031 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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