Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF2O60811 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms