Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FANCAO15360 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FANCAO15360 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FANCAO15360 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FANCAO15360 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms