Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRTO14522 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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