Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DGG1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DGG1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DGG1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DGG1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DGG1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DGG1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DGG1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DGG1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
B4DGG1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms