Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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