Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRAP3Q9Y2W1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms