Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGSF9BQ9UPX0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGSF9BQ9UPX0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms