Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNX7Q9UNH6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNX7Q9UNH6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms