Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MRTO4Q9UKD2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms