Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXD3Q9UJU5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXD3Q9UJU5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXD3Q9UJU5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXD3Q9UJU5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXD3Q9UJU5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD3Q9UJU5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD3Q9UJU5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD3Q9UJU5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXD3Q9UJU5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXD3Q9UJU5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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