Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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