Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNAL1Q9UBT7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms