Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDP1Q9P0J1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms