Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC52A1Q9NWF4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC52A1Q9NWF4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms