Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIMMDC1Q9NPL8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms