Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLC6A20Q9NP91 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC6A20Q9NP91 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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