Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPHS2Q9NP85 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms