Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMG20AQ9NP66 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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