Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms