Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL4Q9C0H6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms