Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ASXL3Q9C0F0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms