Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA4CQ9C0C4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms