Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSDMCQ9BYG8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms