Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BBS2Q9BXC9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms