Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBA1CQ9BQE3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBA1CQ9BQE3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms