Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PCNX1Q96RV3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PCNX1Q96RV3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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