Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NMD3Q96D46 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms